FILOMENE

France-Investigation LOngitudinale sur les Maladies et l’ENvironnement dans l’Enfance

FILOMENE est un projet de cohorte pédiatrique France entière, à recrutement prénatal, ayant pour ambition de recruter 100 000 futurs parents au cours de la grossesse, et de suivre la santé et le développement de leur enfant jusqu’à l’âge adulte.

Elle constituera une plateforme de recherche ouverte à la communauté scientifique sur le long terme, destinée à l’étude de l’exposome au sens large (facteurs physiques, chimiques, biologiques, psychosociaux et comportementaux, ainsi que les facteurs endogènes) et son impact sur la santé et le développement dès le début de la vie.

La mise en place de la cohorte FILOMENE s’inscrit dans le plan Innovation Santé de France 2030.

Objectifs de la cohorte

  • Caractériser le rôle des expositions au début de la vie sur le développement et la santé tout au long de la vie.
  • Étudier les mécanismes biologiques qui sous-tendent l'effet des facteurs de risque identifiés.
  • Étudier ces problématiques parmi des groupes de populations vulnérables (socialement ou médicalement) et dans des régions à risque, grâce au design France entière de la cohorte, incluant les départements et régions d’outre-mer.
  • Contribuer au développement et à l'enrichissement des données sur la grossesse et la santé pédiatrique et améliorer la structuration des données recueillies en routine.

Méthodologie de recueil envisagée

  • Un recrutement maternel précoce, pendant la grossesse.
  • Une collecte active de données et d'échantillons biologiques (urine, cheveux, dents, sang, sang du cordon ombilical, placenta, selles…) pendant la grossesse et jusqu’à deux ans après la naissance, soit la période des « 1000 premiers jours ».
  • Jusqu'au début de l'âge adulte, poursuite ponctuelle d’un recueil actif et de la réalisation de prélèvements biologiques combinée à un recueil passif de données par couplage avec des bases de données nationales (Système National des Données de Santé (SNDS), registre national des cancers de l'enfant et d'autres registres nationaux de maladies, entrepôts de données hospitalières régionaux …).

Cette méthodologie s’inspire de cohortes françaises existantes. Vous pouvez consulter leurs protocoles et le type de données qui y sont recueillies ici.

Image
Schéma de recueil d'information

Calendrier prévisionnel

  • Une première phase "pilote" sera mise en place au premier semestre 2027. Elle permettra de consolider les modalités de recrutement et de recueil d'information.
  • La deuxième phase, à partir de 2028, sera consacrée au déploiement national du recrutement

Gouvernance

La cohorte FILOMENE est placée sous la responsabilité scientifique de Barbara Heude, épidémiologiste, Directrice de Recherche Inserm, CRESS et du Pr Romain Basmaci, chef du service de Pédiatrie Générale, Hôpital Louis Mourier, en collaboration avec l’équipe projet constituée d’épidémiologistes et d’experts en cohortes mères-enfants.

Avec le soutien de :

Image
Logos partenaires FILOMENE

195 manifestations d’intérêt de la part de 117 équipes pour coconstruire FILOMENE

Un appel à manifestation d’intérêt non compétitif a été ouvert à la communauté scientifique de septembre à octobre 2025, afin de l’inviter à coconstruire la cohorte, de façon pluridisciplinaire. 

Nous avons reçu 195 manifestations d'intérêt provenant de 117 équipes très diverses, représentant un large éventail de disciplines et de zones géographiques, tant en France métropolitaine que dans ses territoires d'outre-mer (voir figures ci-dessous).

L’équipe projet remercie très sincèrement les porteuses et les porteurs de projets pour leur participation.

Image
Carte de France des réponses à l'AMI
Image
Répartition des instituts de recherche ayant répondu à l'AMI

État d’avancement du processus d’évaluation

L’évaluation des projets par les membres de l’équipe est actuellement en cours. Les critères principaux retenus pour cette évaluation sont : 

  • l’orientation vers les facteurs environnementaux,
  • l’étude d’une problématique présentant un fardeau important en termes de santé publique,
  • l’originalité,
  • le degré de faisabilité.

 

Un retour personnalisé sera fait au début de l’année 2026.

Constitution de groupes de travail thématiques

Des thèmes prioritaires se dégagent déjà, qui nous ont conduit à mettre en place des groupes de travail thématiques.

Ces groupes de travail, constitués de chercheurs et de cliniciens, vont avoir pour rôles essentiels d’arbitrer les orientations stratégiques de la cohorte, de remonter les besoins exprimés au cours des réunions de travail, en termes de collecte de données, de proposer et développer des outils adaptés, de rechercher des financements ad-hoc, de valoriser les données collectées.

Voici la liste des groupes de travail thématiques en cours de constitution :

Image

Webinaire d'information

Vous souhaitez plus d’information sur la cohorte ? Vous pouvez visionner la captation vidéo du webinaire de présentation de la cohorte ci-dessous.

FOIRE AUX QUESTIONS

Informations générales sur la cohorte

  • Qui porte la cohorte ?

    La cohorte n’est pas encore créée et est en cours de co-construction grâce à cet appel à manifestation d’intérêt (AMI). Elle est soutenue par l’Institut de Santé Publique de l’Inserm et coordonnée par Barbara Heude (Directrice de recherche, Equipe OPPaLE, CRESS, UMR1153, Paris) et Romain Basmaci (Chef de service de Pédiatrie Générale, Hôpital Louis Mourier, AP-HP, Colombes). 

    Valérie Benhammou (Ingénieure de recherche, Equipe OPPaLE, CRESS, UMR1153, Paris) en assure la direction opérationnelle.

  • Combien de couples mère/enfant pensez-vous recruter au niveau régional et national ?

    Les objectifs en termes de nombre au niveau régional et dans les DROM ne sont pas encore fixés. Au niveau national, l’ambition du projet est d’inclure 100 000 enfants accompagnés de leurs parents. Si vous soumettez un projet, veuillez indiquer le nombre nécessaire pour répondre à votre question de recherche afin d’évaluer la faisabilité. 

  • Quel est le budget prévu ?

    Le budget alloué permettra la mise en place de la phase d’inclusion et d’une première étape de suivi des enfants (Phases 1 et 2). Cependant, des financements complémentaires devront être recherchés pour organiser le suivi des enfants à plus long terme et mener des questions de recherche ancillaires.

  • Quelle est la durée prévue de recrutement ?

    Le recrutement de la phase 1 sera réalisée sur une année. Pour la phase 2, nous envisageons entre 2 et 3 ans de recrutement en fonction 1/ du nombre de territoires participants, 2/ de la capacité de recrutement. La durée de cette deuxième phase sera affinée suite aux enseignements de la phase 1.

  • Des auto-prélèvements sont-ils prévus ?

    Oui, des auto-prélèvements de salive, sang sur buvard, cheveux, urines sont envisagés. Leur mise en œuvre sera conditionnée à leur pertinence au regard des projets classés comme prioritaires.

  • Des prélèvements de type placenta, liquide amniotique, laits maternels sont-ils prévus ?

    Oui, ces prélèvements peuvent être discutés. Leur mise en œuvre sera conditionnée à leur pertinence au regard des projets classés comme prioritaires.

  • Est-il envisageable de recueillir des échantillons biologiques chez les pères ?

    Oui, nous prévoyons de recueillir des échantillons biologiques chez le père. Leur nature sera définie à partir des projets classés comme prioritaires à l’AMI.

  • Où seront hébergées les données collectées ?

    Les données recueillies dans la cohorte FILOMENE seront hébergées au sein de l’infrastructure France Cohortes. France cohortes est une infrastructure nationale placée sous l’égide de l’Inserm, soutenue par un programme d’Investissement d’Avenir. Sa mission est d’accompagner les cohortes tout au long du cycle de vie de leurs projets, du recueil des données à leur exploitations et leur mise à disposition.

Pour toute question contacter cohorte.filomene@inserm.fr