Les cohortes suivent dans le temps des populations incluses sur la base d'un protocole connu et maitrisé, afin d’identifier la survenue d’événement de santé d’intérêt (maladie, dysfonctionnement de l’organisme, qualité de vie...).
Ces instruments d'observation exceptionnels s'appuient sur des données individuelles collectées sur une longue période de temps, qui peuvent être mobilisés pour la recherche et les études en santé.
Dans un contexte grandissant de données massives et hétérogènes, de recueil systématique et d’ouverture des données, les cohortes en santé font cependant face à de nombreux défis.
Ces derniers sont liés à la protection de la vie privée, au partage des données, à l’intégration et au maintien d’outils techniques de suivi et de systèmes informatiques performants et, plus généralement, à leur pérennisation, la valeur d’une cohorte ayant tendance à apparaître au cours du temps.